RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CALHM3Q86XJ0 350 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MFSD4AQ8N468 514 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PARP16Q8N5Y8 322 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ZFP41Q8N8Y5 198 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PRR14Q9BWN1 585 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFAF4Q9P032 175 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 WNT6Q9Y6F9 365 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35F4A4IF30 521 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 AP3D1O14617 1153 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 NNMTP40261 264 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MAGEA8P43361 318 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CDK6Q00534 326 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PROX2Q3B8N5 592 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 IFI44LQ53G44 452 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CBLL1Q75N03 491 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM48Q8IWZ4 208 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 YIPF6Q96EC8 236 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB118Q96PH6 123 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TTLL2Q9BWV7 592 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD36A6QL64 1941 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 M0R082 166 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ACRP10323 421 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SOX6P35712 828 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 GZMMP51124 257 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 WNT3P56703 355 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SELENBP1Q13228 472 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 GCNT6Q5T4J0 391 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ART5Q96L15 291 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MGLLQ99685 303 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SH2B3Q9UQQ2 575 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM221A6NGB7 291 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ZW10O43264 779 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF10O60809 474 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RFPL2O75678 378 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 AP2A2O94973 939 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ELFN1P0C7U0 828 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 GPC1P35052 558 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 METAP1P53582 386 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RAB25P57735 213 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MPPE1Q53F39 396 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LRIF1Q5T3J3 769 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PAQR6Q6TCH4 344 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM150AQ86TG1 271 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 APH1BQ8WW43 257 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 OR4K3Q96R72 315 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ABCG4Q9H172 646 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 IL20RAQ9UHF4 553 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TMCC3Q9ULS5 477 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ASF1AQ9Y294 204 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 DYRK1BQ9Y463 629 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PRB8 838 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 OR2A25A4D2G3 310 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CLCA1A8K7I4 914 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LEFTY2O00292 366 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 SGTAO43765 313 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 MANFP55145 182 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 CDC42P60953 191 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 KCNJ10P78508 379 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP7Q16829 419 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 ZMAT1Q5H9K5 638 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 LIPKQ5VXJ0 399 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 GDPD4Q6W3E5 623 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-201ENST00000259365 COMMD6Q7Z4G1 85 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms