RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PCMT1P22061 227 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GRK3P35626 688 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGCLP35914 325 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 OPRL1P41146 370 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNAB2Q13303 367 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SPCS2Q15005 226 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 AP5B1Q2VPB7 878 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR4Q86WZ0 1026 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FIG4Q92562 907 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ALPK1Q96QP1 1244 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83DQ9H4H8 585 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DAPK2Q9UIK4 370 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 HTR1BP28222 390 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX11P35716 441 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCR4P61073 352 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DPTQ07507 201 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CTF1Q16619 201 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MEP1AQ16819 746 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG9BQ674R7 924 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RBFAQ8N0V3 343 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TAMM41Q96BW9 452 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKHQ9HCJ1 492 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO8Q9NRD0 319 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TM7SF3Q9NS93 570 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC28A1O00337 649 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PCNAP12004 261 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR1P46091 355 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DGUOKQ16854 277 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM162AQ96A26 154 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 INIPQ9NRY2 104 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTQ1 180 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C0S8 307 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCR6O00574 342 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 HALP42357 657 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK10P53779 464 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 YPEL5P62699 121 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPG1Q17R60 797 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP7Q6UWV6 458 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NRSN1Q8IZ57 195 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7A2PQ8NGA2 310 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2H4Q92759 462 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX101Q9BY14 249 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR26Q9H7D7 661 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 SMURF2Q9HAU4 748 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 IL26Q9NPH9 171 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM220BPB1ANY3 271 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 E5RI56 91 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR47O94967 919 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CER1O95813 267 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CD59P13987 128 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MLLT10P55197 1068 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK3Q00526 305 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 MICU2Q8IYU8 434 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF22Q9HCT0 170 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 VAPAQ9P0L0 249 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD3Q9Y2F9 522 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 TPRKBQ9Y3C4 175 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2H2Q13888 395 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 RUNDC3AQ59EK9 446 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO48Q5FWF7 155 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSL3PQ5NE16 218 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP6Q6UWR7 440 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 RD3Q7Z3Z2 195 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO30Q8TB52 745 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PDXPQ96GD0 296 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa25.27■■□□□ 1.64
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