RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052462.12

Pdpk1-201, Transcript of 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdpk1, Length 1,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr1085Q7TR64 313 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr813Q7TRH5 310 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Megf11Q80T91 1091 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 CyrenQ8BHZ5 157 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Zhx3Q8C0Q2 951 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 TrhdeQ8K093 1025 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tspan14Q8QZY6 270 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dusp15Q8R4V2 235 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr77Q8VEY9 312 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 4930519G04RikQ9CPT7 205 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Mcm8Q9CWV1 833 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 AcoxlQ9DBS4 632 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Hmgn3Q9DCB1 99 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ndufa13Q9ERS2 144 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Insm2Q9JMC2 493 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Khdrbs2Q9WU01 349 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Srd5a3Q9WUP4 330 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm29797A0A140LIA7 188 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm8011K7N6Y5 207 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tspan6O70401 245 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Nid1P10493 1245 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 H2-Q7P14429 334 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 H2-Q9P14431 200 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Slc6a12P31651 614 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Prim2P33610 505 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cct8P42932 548 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Plk5Q4FZD7 595 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Taar7bQ5QD11 358 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Nr1h4Q60641 488 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 KdsrQ6GV12 332 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 RimklaQ6PFX8 380 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr128Q7TRJ1 308 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Nkiras1Q8CEC5 192 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Scamp1Q8K021 338 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Oard1Q8R5F3 152 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr1278Q8VF39 313 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fig4Q91WF7 907 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Mrps18bQ99N84 254 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dsn1Q9CYC5 348 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Borcs5Q9D920 195 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Inpp5eQ9JII1 647 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Arpc3Q9JM76 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Aqp5Q9WTY4 265 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 CtszQ9WUU7 306 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 A0A1L1ST33 502 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm8922F6XVS9 199 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fmo6J3QMN6 532 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 AldocP05063 363 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Slc30a3P97441 388 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Fezf1Q0VDQ9 475 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Kcna7Q17ST2 489 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tstd2Q3U269 495 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 MogQ61885 246 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Jak3Q62137 1100 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Brinp2Q6DFY8 783 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 DgkbQ6NS52 802 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 HjurpQ6PG16 667 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr871Q7TRF0 311 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gykl1Q8C635 549 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn1r234Q8R298 329 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr952Q8VFD7 314 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Frmd4bQ920B0 1035 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Chid1Q922Q9 393 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Msh4Q99MT2 958 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Q9CXL3 195 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Slc52a3Q9D6X5 460 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Zswim2Q9D9X6 631 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr955Q9EQ97 314 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cib1Q9Z0F4 191 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Scgb2b17S4R2V3 82 aa14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Plce1Q8K4S1 2282 aa14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Pgm2A2CEK3 580 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Galntl6E5D8G1 601 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Zfp599E9PWP1 548 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm8879F6R3J9 157 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Gm5145F8VQ88 278 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Vmn1r31L7N2F1 303 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Srp54P14576 504 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Polr1bP70700 1135 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Dab2P98078 766 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Olfr325Q5NCD2 326 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Ostf1Q62422 215 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Tha1Q6XPS7 400 aa14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1-201ENSMUST00000052462 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.9 ms