RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Col18a1P39061 1774 aa10.6□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ap1arE9PYF7 298 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ChadlE9Q7T7 748 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr237-ps1K9J725 310 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fkbp7O54998 218 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo40P62932 710 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ube2j2Q6P073 259 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pomt2Q8BGQ4 820 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fzd10Q8BKG4 582 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl38Q8K2M0 380 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r185Q8R299 319 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mlf2Q99KX1 247 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rex2A2AWF2 685 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm5796E9Q7M8 205 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3542K7N6U2 270 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3629K7N6Y2 205 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10340K7N708 205 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3696K7N751 203 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm8281L7N235 204 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 DbiP31786 87 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ThpoP40226 356 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cct3P80318 545 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q6P2K3 674 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 B3gnt5Q8BGY6 376 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prps1l1Q8C5R8 318 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc38a4Q8R1S9 547 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Actl6bQ99MR0 426 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mzt2Q9CQ25 159 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tor1bQ9ER41 336 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Serinc3Q9QZI9 472 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ttll11A4Q9F4 727 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam71aB7XG49 585 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 JhyE9Q793 770 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10719E9Q7T3 227 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Omt2aF6ZJR3 104 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp37P17141 594 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zp2P20239 713 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem165P52875 323 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MedagQ14BA6 303 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Paqr9Q6TCG2 375 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr792Q7TRH9 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpp38Q80UU2 280 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam53cQ8BXQ8 393 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aqp12Q8CHJ2 290 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr103Q920Y8 313 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pacsin3Q99JB8 424 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Efhc1Q9D9T8 648 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fabp12Q9DAK4 132 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PrepQ9QUR6 710 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr172E9Q8F6 309 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csf2P01587 141 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01631 113 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxb6P09023 224 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gdpd5Q640M6 607 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PianpQ6P1B3 278 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RfflQ6ZQM0 377 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shisa4Q8CA71 197 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ubqln1Q8R317 582 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr357Q8VFP4 308 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nsmce2Q91VT1 247 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdzd3Q99MJ6 498 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Twsg1Q9EP52 222 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Extl1Q9JKV7 669 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mocs2Q9Z223 189 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wnk3Q80XP9 1757 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr740E9PV79 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Psmc3ipO35047 217 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rgs7O54829 469 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tyrp1P07147 537 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Srp54P14576 504 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cd82P40237 266 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Id2P41136 134 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SmsP97355 366 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tgtp2Q3T9E4 415 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Emc10Q3TAS6 258 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q3TTL0 348 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tgtp1Q62293 415 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pih1d2Q8CHR9 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Impa2Q91UZ5 290 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Elmod3Q91YP6 381 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr459Q924H8 314 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dsn1Q9CYC5 348 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stpg4Q9DAG5 247 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf32Q9JIT1 368 aa10.59□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr171G5E8J1 314 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm6502L7N456 481 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nrp2O35375 931 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ca3P16015 260 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms