RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm44G3UW88 330 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6356L7N2A7 188 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HpnO35453 436 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs7O54829 469 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdlim1O70400 327 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tulp3O88413 460 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc10a2P70172 348 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lingo4Q149C3 593 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Havcr1Q5QNS5 305 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fblim1Q71FD7 375 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hfe2Q7TQ32 420 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1152Q7TR34 310 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cox14Q8BH51 57 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elmo1Q8BPU7 727 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a11Q8K0E3 673 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a37Q920G8 338 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpinb1aQ9D154 379 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kbtbd12Q9D618 625 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PgdQ9DCD0 483 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nectin3Q9JLB9 549 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HaspinQ9Z0R0 754 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm29776A0A286YEC0 699 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5c1aA3KFX0 365 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17615E9Q9P2 165 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm17093F6XGJ4 214 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Suv39h1O54864 412 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Capns1O88456 269 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P01648 108 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cma1P21844 247 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgtp2Q3T9E4 415 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd28Q505D1 1053 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tgtp1Q62293 415 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr320Q7TRZ4 306 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam131aQ8BWU3 361 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35b4Q8CIA5 331 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrg1Q8K209 687 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35a2Q9R0M8 390 aa16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp383A0A087WRR7 490 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AccsA2AIG8 502 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mup6A2AV72 179 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs14P97492 547 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc37a3Q3TIT8 494 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Upf3aQ3ULJ3 422 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snta1Q61234 503 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atg16l2Q6KAU8 623 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Med26Q7TN02 588 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BtdQ8CIF4 520 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam129bQ8R1F1 749 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr561Q8VGZ6 314 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arl10Q9QXJ4 243 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mybpc1D3YU50 1127 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtgdsO09114 189 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr25P0C5I1 358 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phxr1P15973 60 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cst3P21460 140 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scn1bP97952 218 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam47cQ14BE7 430 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nr1d2Q60674 576 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1322Q7TQW3 310 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AntxrlQ8BVM2 641 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhs1Q8BW88 474 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abhd18Q8C1A9 464 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps37aQ8CHS8 397 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtrf1Q8K126 446 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Armcx6Q8K3A6 301 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spon1Q8VCC9 807 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr986Q8VFN6 312 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgre4Q91ZE5 689 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl54Q9CPW3 135 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 9230112D13RikQ9D260 137 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AcoxlQ9DBS4 632 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Htra1Q9R118 480 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srd5a3Q9WUP4 330 aa16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprsB0V2N1 1907 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14459A2BI73 179 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btnl4A2CG29 586 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 A530032D15RikE9Q422 215 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10639E9Q6L7 222 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5861F6VCN9 180 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4933402N22RikF7D1B3 190 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AF366264G3X9P9 502 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shisa8J3QNX5 399 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TertO70372 1122 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk16O88697 305 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxd4P10628 250 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rph3aP47708 681 aa16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a1P53986 493 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.9 ms