RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592159.1

KDM4B-209, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4B, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PELI2Q9HAT8 420 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 POT1Q9NUX5 634 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 C1orf109Q9NX04 203 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.3□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 FEZF1A0PJY2 475 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 B2RBV5 119 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 BTN3A3O00478 584 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SLC22A2O15244 555 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 OR1F1O43749 312 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 NOBOXO60393 691 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 FAM87AP0C7U9 286 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PRR35P0CG20 571 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 THRAP10827 490 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 LIPCP11150 499 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 IDO1P14902 403 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CALB2P22676 271 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PRDX6P30041 224 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RASSF2P50749 326 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ATP4BP51164 291 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 DIO3P55073 304 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 HHEXQ03014 270 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 EMX2Q04743 252 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CUL3Q13618 768 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 GSTA3Q16772 222 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 COLEC12Q5KU26 742 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 OGFOD2Q6N063 350 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RINLQ6ZS11 566 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 GK5Q6ZS86 529 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 KYQ8NBH2 561 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 KLHL29Q96CT2 875 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 WDR34Q96EX3 536 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 STARD5Q9NSY2 213 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MRGBPQ9NV56 204 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 AIG1Q9NVV5 245 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CCL27Q9Y4X3 112 aa9.29□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 D6RAR5 112 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SUV39H1O43463 412 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MYO1DO94832 1006 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 TGFB1P01137 390 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 SERPIND1P05546 499 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CD1EP15812 388 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 TYRP1P17643 537 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ITIH1P19827 911 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 GPX3P22352 226 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 GRK3P35626 688 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MNAT1P51948 309 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 PDX1P52945 283 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CYP4F2P78329 520 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 CSNK1G2P78368 415 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ABATP80404 500 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ZNF33BQ06732 778 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 HERC3Q15034 1050 aa9.28□□□□□ -0.92
KDM4B-209ENST00000592159 MAPRE2Q15555 327 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms