RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 A0A0G2JNG1 304 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FBP2O00757 339 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 YKT6O15498 198 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PRMT3O60678 531 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SEC22BO75396 215 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CSF2P04141 144 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CD1EP15812 388 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GSTM2P28161 218 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MAPK1P28482 360 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CD38P28907 300 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SHMT2P34897 504 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ACTR1BP42025 376 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CPA2P48052 419 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CLDN8P56748 225 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ACTR1AP61163 376 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PRKG2Q13237 762 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KIR2DS5Q14953 304 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SPATS1Q496A3 300 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PAOXQ6QHF9 649 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PARGQ86W56 976 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 HID1Q8IV36 788 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 DSELQ8IZU8 1212 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KRT78Q8N1N4 520 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MARK4Q96L34 752 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 IL17FQ96PD4 163 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ACTL8Q9H568 366 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KLF15Q9UIH9 416 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CACNA1DQ01668 2161 aa11.44□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PIPSLA2A3N6 862 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TLR4O00206 839 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CSO75390 466 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CCNDBP1O95273 360 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FKBP9O95302 570 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 EML2O95834 649 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 G6PDP11413 515 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 BCKDHAP12694 445 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 AMD1P17707 334 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC19A1P41440 591 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CCR8P51685 355 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 NEK2P51955 445 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ARFIP1P53367 373 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A3Q00325 362 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 HMGCS1Q01581 520 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 RELAQ04206 551 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FOXM1Q08050 763 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CUL3Q13618 768 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KRT33BQ14525 404 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TLR1Q15399 786 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SGO1Q5FBB7 561 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ICE2Q659A1 982 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 GK5Q6ZS86 529 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 USP53Q70EK8 1073 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 DPP10Q8N608 796 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 AVL9Q8NBF6 648 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 FAM13CQ8NE31 585 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 RCN3Q96D15 328 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC6A18Q96N87 628 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 POT1Q9NUX5 634 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 MAP10Q9P2G4 905 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 ICKQ9UPZ9 632 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
GGA3-217ENST00000583667 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms