RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	MIB2	Q96AX9	1013 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MOCOS	Q96EN8	888 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR78	Q96P69	363 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUDT9	Q9BW91	350 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		12.91	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MED13	Q9UHV7	2174 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SGK494	L7N484	410 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBXN8	O00124	270 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAP2K7	O14733	419 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUPT3H	O75486	399 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALPP	P05187	535 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	HEXB	P07686	556 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	COL6A2	P12110	1019 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACPP	P15309	386 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	EPOR	P19235	508 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	IRF9	Q00978	393 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	HYAL2	Q12891	473 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	LAPTM5	Q13571	262 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYT16	Q17RD7	645 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM205	Q6UW68	189 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR1F2P	Q96R84	312 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	FETUB	Q9UGM5	382 aa		12.9	□□□□□ -0.34
CSNK1D-208	ENST00000578501	NBAS	A2RRP1	2371 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501		K7EPI3	171 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FFAR3	O14843	346 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPR42	O15529	346 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIPK2	O43353	540 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLK8	O60259	260 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	DPM1	O60762	260 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAMEF4	O60810	478 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RDH16	O75452	317 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLEC3A	O75596	197 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGFG2	O95081	481 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERPIND1	P05546	499 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	XCR1	P46094	333 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SETDB1	Q15047	1291 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FHL5	Q5TD97	284 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LGSN	Q5TDP6	509 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	12.89	□□□□□ -0.35	1e-6	■□□□□ 10.9
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNX31	Q8N9S9	440 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EXT2	Q93063	718 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ESAM	Q96AP7	390 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHBG	Q9H310	441 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		12.89	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RELN	P78509	3460 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRIT2	A6NDA9	550 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALOX12B	O75342	701 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	WFS1	O76024	890 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBP1	P09455	135 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM153B	P0C7A2	387 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	COX6A1	P12074	109 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GLRB	P48167	497 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGTR2	P50052	363 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IRF8	Q02556	426 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	DOC2A	Q14183	400 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM153C	Q494X1	144 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEFB134	Q4QY38	66 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	XKR6	Q5GH73	641 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		12.88	□□□□□ -0.35

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