RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 B4GALT2O60909 372 aa16.77■□□□□ 0.28
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CTDNEP1-207ENST00000572043 SNX15Q9NRS6 342 aa16.75■□□□□ 0.27
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CTDNEP1-207ENST00000572043 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 DOC2AQ14183 400 aa16.74■□□□□ 0.27
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CTDNEP1-207ENST00000572043 NR6A1Q15406 480 aa16.74■□□□□ 0.27
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