RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564343.5

TCF4-223, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 4

Gene TCF4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-223	ENST00000564343	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AGPS	O00116	658 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PROSC	O94903	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	STS	P08842	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MSH3	P20585	1137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PTPN3	P26045	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AKT1	P31749	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PTPN7	P35236	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HADHA	P40939	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FOLR3	P41439	243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GABRA4	P48169	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZIC1	Q15915	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	STX1A	Q16623	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PTER	Q96BW5	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ARL5A	Q9Y689	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PEX12	O00623	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SOCS6	O14544	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	APOL1	O14791	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AKR1B10	O60218	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OR2B3	O76000	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ESRRB	O95718	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IL33	O95760	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HBQ1	P09105	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ITGAX	P20702	1163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ENPP1	P22413	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ITGA3	P26006	1051 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NDUFS1	P28331	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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