RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560890.5

APH1B-210, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-210ENST00000560890 APMAPQ9HDC9 416 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 CUTCQ9NTM9 273 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PNPOQ9NVS9 261 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 HAO1Q9UJM8 370 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 PPT2Q9UMR5 302 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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APH1B-210ENST00000560890 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.4□□□□□ -1.06
APH1B-210ENST00000560890 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 HDAC3O15379 428 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SH3BGRLO75368 114 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 STATHP02808 62 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 NTRK1P04629 796 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CTSBP07858 339 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 LINC00032P0C843 101 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 KITP10721 976 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ALOX12P18054 663 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 AGXTP21549 392 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 AVPR1BP47901 424 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RAP1GDS1P52306 607 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ARFIP1P53367 373 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PLA2G16P53816 162 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RAB8AP61006 207 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 BTN3A2P78410 334 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RTP5Q14D33 572 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 HERC3Q15034 1050 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 HKDC1Q2TB90 917 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TRIM40Q6P9F5 258 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 OR2L5Q8NG80 312 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 MS4A6EQ96DS6 147 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 MVB12AQ96EY5 273 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.39□□□□□ -1.07
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APH1B-210ENST00000560890 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.39□□□□□ -1.07
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APH1B-210ENST00000560890 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.39□□□□□ -1.07
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APH1B-210ENST00000560890 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TMEM131Q92545 1883 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 FAM186AA6NE01 2351 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 A0A1B0GX78 115 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TMEM233B4DJY2 109 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 C9orf172C9J069 976 aa8.38□□□□□ -1.07
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APH1B-210ENST00000560890 H3BMH7 237 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 MEN1O00255 615 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 DSCR3O14972 297 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 PIP5K1BO14986 540 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 P2RX6O15547 441 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 VPS4BO75351 444 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SEC22BO75396 215 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 STK17BO94768 372 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 MYO1DO94832 1006 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 KIAA0754O94854 1291 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SEMA3DO95025 777 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 TGDSO95455 350 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SMIM10L1P0DMW3 83 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 CD82P27701 267 aa8.38□□□□□ -1.07
APH1B-210ENST00000560890 SLC5A2P31639 672 aa8.38□□□□□ -1.07
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