RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TBK1Q9UHD2 729 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MID2Q9UJV3 735 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 C3orf18Q9UK00 162 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 WFS1O76024 890 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 UMODP07911 640 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 FURINP09958 794 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM87AP0C7U9 286 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IL1RNP18510 177 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 GCAP28676 217 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 HSD17B3P37058 310 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 AGTR2P50052 363 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CCNG1P51959 295 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ARFIP1P53367 373 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP1A4Q13733 1029 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC153Q494R4 210 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CROCCP2Q86T23 111 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 AMER3Q8N944 861 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ESAMQ96AP7 390 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SPACA6W5XKT8 324 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IDSB3KWA1 339 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BMP10O95393 424 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MED26O95402 600 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CLDN9O95484 217 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ICAM2P13598 275 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PIK3CBP42338 1070 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 XCR1P46094 333 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LY6DQ14210 128 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DEFB134Q4QY38 66 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 VWA2Q5GFL6 755 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DCAF10Q5QP82 559 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LAS2Q8IYD9 372 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR2L5Q8NG80 312 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TM9SF4Q92544 642 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PHF21BQ96EK2 531 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNC2Q96PR1 638 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IPPKQ9H8X2 491 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BLACEA4D250 179 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC151A5D8V7 595 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LRIT2A6NDA9 550 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 H0YIV9 168 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 H3BQF6 201 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SGK494L7N484 410 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GALT2O43825 422 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RDH16O75452 317 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ERLIN1O75477 346 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OTCP00480 354 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HPP00738 406 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PYGBP11216 843 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PCNAP12004 261 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PGDP52209 483 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SOX8P57073 446 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms