RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985		K7EPI3	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SUV39H1	O43463	412 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KLK8	O60259	260 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHE	P01854	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SHBG	P04278	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HEXB	P07686	556 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SERPINA6	P08185	405 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GFAP	P14136	432 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CNTF	P26441	200 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PGD	P52209	483 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		Q0VFX4	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CHIT1	Q13231	466 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HERC3	Q15034	1050 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF605	Q86T29	641 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TRPV3	Q8NET8	790 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NACC2	Q96BF6	587 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SMIM10	Q96HG1	83 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NT5DC2	Q9H857	520 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	OPTC	Q9UBM4	332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0G2JN53	185 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CHST10	O43529	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC28A2	O43868	658 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	WFS1	O76024	890 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SBK3	P0C264	359 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	COX6A1	P12074	109 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ACPP	P15309	386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CXCR2	P25025	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CASP2	P42575	452 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	IRF8	Q02556	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	E2F2	Q14209	437 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TBCC	Q15814	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM205	Q6UW68	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD13	Q7L211	337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CCT6B	Q92526	530 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PEX11G	Q96HA9	241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PQ72	361 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	LRIT2	A6NDA9	550 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ESPN	B1AK53	854 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA8R	I6L899	631 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	E2F3	O00716	465 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC3A	O75596	197 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	HP	P00738	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CELA2A	P08217	269 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RBP1	P09455	135 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	COL6A2	P12110	1019 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	EPB42	P16452	691 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	ITGA3	P26006	1051 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	CD97	P48960	835 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	SOX8	P57073	446 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	VSNL1	P62760	191 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	RHAG	Q02094	409 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TPCN1-223	ENST00000552985	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms