RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	PCM1	Q15154	2024 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C2orf74	A8MZ97	194 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SLC19A2	O60779	497 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KLHL2	O95198	593 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CLDN14	O95500	239 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	COL6A2	P12110	1019 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KLK2	P20151	261 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MMP11	P24347	488 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IMPA1	P29218	277 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CDKL1	Q00532	357 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KIR2DS3	Q14952	304 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OR4D1	Q15615	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	GPR135	Q8IZ08	494 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PSMF1	Q92530	271 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	OR2A14	Q96R47	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SPSB2	Q99619	263 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ARL15	Q9NXU5	204 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPM1	405 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPV9	198 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222		E7ENX8	843 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	IGHE	P01854	428 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TFEB	P19484	476 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	KCNC1	P48547	511 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TNFSF10	P50591	281 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TAP2	Q03519	686 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ACAP2	Q15057	778 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TGFBI	Q15582	683 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	NKG7	Q16617	165 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	GPSM1	Q86YR5	675 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CARF	Q8N187	725 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	FBXL8	Q96CD0	374 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
CS-231	ENST00000552222	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	KLHL41	O60662	606 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	KERA	O60938	352 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	GUCA1C	O95843	209 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	PYGB	P11216	843 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	UGT2B7	P16662	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	KRT15	P19012	456 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	OR1D4	P47884	311 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	HSF1	Q00613	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13.08	□□□□□ -0.32
CS-231	ENST00000552222	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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