RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CHSY3Q70JA7 882 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 COL20A1Q9P218 1284 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DAW1Q8N136 415 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM104Q8NE00 496 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PTERQ96BW5 349 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM209Q96SK2 561 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BDH2Q9BUT1 245 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.11□□□□□ -1.43
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