RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM156Q8N614 296 aa8.23□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 GPX6P59796 221 aa8.21□□□□□ -1.09
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PTPRB-208ENST00000550358 SERTAD2Q14140 314 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 ARL6IP1Q15041 203 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 ABCA11PQ4W5N1 156 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf27AQ580R0 203 aa8.21□□□□□ -1.09
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