RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	HCN1	O60741	890 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	OR6B1	O95007	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	MATN4	O95460	622 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	EPPIN	O95925	133 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SERPING1	P05155	500 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	FH	P07954	510 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CCNF	P41002	786 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SSR4	P51571	173 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	GPR143	P51810	404 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	RUNX1T1	Q06455	604 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TNK1	Q13470	666 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SLC10A1	Q14973	349 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ACKR1	Q16570	336 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CYP4X1	Q8N118	509 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		10.43	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298		A8MUA0	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298		E7ENX8	843 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298		H7BY64	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	MYO1C	O00159	1063 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	KIF5C	O60282	957 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CNR1	P21554	472 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TIMP3	P35625	211 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PTH2R	P49190	550 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CLCN2	P51788	898 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TAP2	Q03519	686 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	GBX1	Q14549	363 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CCDC38	Q502W7	563 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PKP4	Q99569	1192 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CCL19	Q99731	98 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	P2RY12	Q9H244	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298		A8MVJ9	347 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298		F8W8V4	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CES2	O00748	559 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	CHST10	O43529	356 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	B4GALT2	O60909	372 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	B3GALT4	O96024	378 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TNNT1	P13805	278 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PAX1	P15863	534 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	MAOA	P21397	527 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	SOX3	P41225	446 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	DNASE1L1	P49184	302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	PNLIPRP1	P54315	467 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	NR1H2	P55055	460 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	OLR1	P78380	273 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ABAT	P80404	500 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	HYAL2	Q12891	473 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	TMED2	Q15363	201 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-208	ENST00000547298	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms