RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 HEXBP07686 556 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GSTA1P08263 222 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 KRT15P19012 456 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TAC1P20366 129 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HNF4AP41235 474 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CCL11P51671 97 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 EMP2P54851 167 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH1Q08174 1060 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 E2F2Q14209 437 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 RASA2Q15283 850 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PDSS2Q86YH6 399 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MZB1Q8WU39 189 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ATMQ13315 3056 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 IDSB3KWA1 339 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8RI6L899 631 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PCDH17O14917 1159 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CDH16O75309 829 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB5O75953 348 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PRB1P04280 392 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PYGBP11216 843 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CD22P20273 847 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 IL10P22301 178 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 XCR1P46094 333 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 RAB8AP61006 207 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HYAL2Q12891 473 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB134Q4QY38 66 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 LIPJQ5W064 366 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MED27Q6P2C8 311 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CAVIN3Q969G5 261 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 FAR2Q96K12 515 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 RHBGQ9H310 441 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 IPPKQ9H8X2 491 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ACTR8Q9H981 624 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa20.78■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 PCSK5Q92824 1860 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 A0A088AWK7 358 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 E2F3O00716 465 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SOCS6O14544 535 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 UGDHO60701 494 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 BMP10O95393 424 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TUBBP07437 444 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 NUDT17P0C025 328 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINB1P30740 379 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 DCAF10Q5QP82 559 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD4BQ5TF39 518 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 LAPTM4BQ86VI4 370 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL31Q9H511 634 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.77■□□□□ 0.92
PTPRK-222ENST00000532751 SCN2AQ99250 2005 aa20.77■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 LRIT2A6NDA9 550 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 GLRA3O75311 464 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 CYC1P08574 325 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 PCNAP12004 261 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 ACPPP15309 386 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 TGM3Q08188 693 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 LAS2Q8IYD9 372 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM10Q96HG1 83 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 OR1F2PQ96R84 312 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 ATRXP46100 2492 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PPM1 405 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms