RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.05■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.05■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 SDK2Q58EX2 2172 aa16.04■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 A8MU76 341 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 H3BMH7 237 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 KRT6CP48668 564 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SEPHS1P49903 392 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 HTR6P50406 440 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TRPV3Q8NET8 790 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 NT5CQ8TCD5 201 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 MIB2Q96AX9 1013 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 TIMM22Q9Y584 194 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.03■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 A0A0J9YVX5 310 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 FFAR3O14843 346 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 GPR42O15529 346 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CLEC3AO75596 197 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 HSD3B2P26439 372 aa16.02■□□□□ 0.16
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PACS1-208ENST00000529677 ARL4DP49703 201 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ACY1Q03154 408 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 IFT88Q13099 833 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 PWP1Q13610 501 aa16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACS1-208ENST00000529677 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.02■□□□□ 0.16
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