RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 TAF4O00268 1085 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 AP2A2O94973 939 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 GJA1P17302 382 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC20Q12834 499 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 MICAQ29983 383 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 TUBA3EQ6PEY2 450 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4C15Q8NGM1 316 aa26.02■■□□□ 1.76
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SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM159Q96B96 161 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF226Q9NYT6 803 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-221ENST00000511747 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa26.01■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 TBX1O43435 398 aa26.01■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 COQ9O75208 318 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 TNFRSF21O75509 655 aa26■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 GRM6O15303 877 aa26■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF181Q2M3W8 571 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP27C1Q4G0S4 372 aa25.99■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR56A3Q8NH54 315 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 COL21A1Q96P44 957 aa25.99■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 PTHP01270 115 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 CATP04040 527 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
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SH3BP2-221ENST00000511747 CRISP3P54108 245 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 SCARB2Q14108 478 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 ARMCX4Q5H9R4 360 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 POC5Q8NA72 575 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 OR9Q2Q8NGE9 314 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-221ENST00000511747 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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