RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A19Q695T7 634 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP128Q6ZU80 1094 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 UBTD2Q8WUN7 234 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAKDQ8WVC6 231 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NACC2Q96BF6 587 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR78Q96P69 363 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NMRAL1Q9HBL8 299 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF358Q9NW07 568 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PLAAQ9Y263 795 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT9Q9Y305 439 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087X1B8 175 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JN53 185 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQ72 361 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC14BA6NHZ5 514 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 STK16O75716 305 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 S100BP04271 92 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 MYBL2P10244 700 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GCAP28676 217 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 HERC3Q15034 1050 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM205Q6UW68 189 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 STAG3L4Q8TBR4 150 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TSLPQ969D9 159 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 ISL2Q96A47 359 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LANCL2Q9NS86 450 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRC5BQ9NZH0 403 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 FLNCQ14315 2725 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DPM1O60762 260 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 WISP1O95388 367 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 INHBAP08476 426 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf89P0DMQ9 161 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 DOC2AQ14183 400 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TECRLQ5HYJ1 363 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKL4Q5MAI5 379 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT6BQ92526 530 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 CD244Q9BZW8 370 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS11Q9H270 941 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB41L4BQ9H329 900 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 COPG2Q9UBF2 871 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL2O95198 593 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM10L1P0DMW3 83 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TYK2P29597 1187 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXK1P85037 733 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RHAGQ02094 409 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 XKR6Q5GH73 641 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD13Q7L211 337 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MIB2Q96AX9 1013 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR34Q96EX3 536 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM10Q96HG1 83 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TXLNGYQ9BZA5 131 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LHPPQ9H008 270 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM49D1C9J1S8 452 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CLGNO14967 610 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RIPK2O43353 540 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CHST10O43529 356 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA6P08185 405 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR35P0CG20 571 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CHIT1Q13231 466 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SETDB1Q15047 1291 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM219BQ5XKK7 198 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFAF7Q7L592 441 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT20Q8IY31 132 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPV3Q8NET8 790 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RHEBL1Q8TAI7 183 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF700Q9H0M5 742 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 EHD1Q9H4M9 534 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 C5AR2Q9P296 337 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ALPPP05187 535 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FHP07954 510 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD2P08910 425 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGAMP11215 1152 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCR2P25025 360 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PFKFB4Q16877 469 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM83EQ2M2I3 478 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX35Q5T0J7 233 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFL3Q6UXB1 125 aa17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms