RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	ILVBL	A1L0T0	632 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KPNA7	A9QM74	516 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	RAD51D	O75771	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CEACAM4	O75871	244 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC16A8	O95907	504 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	AADAC	P22760	399 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CLDN17	P56750	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	OR1D5	P58170	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	STX1B	P61266	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ABR	Q12979	859 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NECTIN1	Q15223	517 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CES4A	Q5XG92	561 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KCTD9	Q7L273	389 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NUP37	Q8NFH4	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	PTP4A1	Q93096	173 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	AGAP3	Q96P47	875 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CUEDC2	Q9H467	287 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A0J9YWU9	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PRV1	198 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284		H3BMM5	538 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CYTIP	O60759	359 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	GOSR1	O95249	250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM49	P0CI25	452 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM49C	P0CI26	452 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	VDR	P11473	427 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP6V1B1	P15313	513 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	UGT1A4	P22310	534 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CTNNB1	P35222	781 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	HNF4A	P41235	474 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SMARCA2	P51531	1590 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CETN1	Q12798	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	MORF4L2	Q15014	288 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM270	Q6UE05	265 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TSSK2	Q96PF2	358 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	UBQLN3	Q9H347	655 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC1A7	O00341	560 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SURF4	O15260	269 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	TTI1	O43156	1089 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP9A	O75110	1047 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SAP30	O75446	220 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRK-215	ENST00000498284	UROS	P10746	265 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms