RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SEC22BO75396 215 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 HMBSP08397 361 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS56P0CW18 603 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PTMSP20962 102 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 AADACP22760 399 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 STARD6P59095 220 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA9Q13797 1035 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PDE7AQ13946 482 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PARP10Q53GL7 1025 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC185Q8N715 623 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM58Q8NG06 486 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SAP25Q8TEE9 199 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT8Q92599 483 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 PRAM1Q96QH2 718 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 IL12RB2Q99665 862 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 POLKQ9UBT6 870 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SATB2Q9UPW6 733 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK6Q9Y257 313 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ND2P03891 347 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD2P08910 425 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A3P43003 542 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A3P55017 1021 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 OR1D5P58170 312 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 WASHC5Q12768 1159 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GRB14Q14449 540 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 FAM46BQ96A09 425 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 GUCD1Q96NT3 240 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM237Q96Q45 408 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 NODALQ96S42 347 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HSF2BPO75031 334 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SAP30O75446 220 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 IL10P22301 178 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN1AP38936 164 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OR3A2P47893 321 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SP3Q02447 781 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF560Q96MR9 790 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM245Q9H330 911 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RNF186Q9NXI6 227 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 FETUBQ9UGM5 382 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 RNF103O00237 685 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A7O00341 560 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GSTA2P09210 222 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 MMP10P09238 476 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF18P17022 549 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 GAP43P17677 238 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNA2P26232 953 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNB4P30926 498 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CASP9P55211 416 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 HUNKP57058 714 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 CDH18Q13634 790 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP5Q16690 384 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NEK11Q8NG66 645 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF732B4DXR9 585 aa6.75□□□□□ -1.33
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