RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ETV6P41212 452 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PYDC2Q56P42 97 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HECTD3Q5T447 861 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SUSD1Q6UWL2 747 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 VWA5B2Q8N398 1253 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 OR52E4Q8NGH9 312 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 DIRAS2Q96HU8 199 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A12Q96S37 553 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TTLL2Q9BWV7 592 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 UCKL1Q9NWZ5 548 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LRFN2Q9ULH4 789 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RIMKLBQ9ULI2 386 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 B4DXG7 233 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 OR7A17O14581 309 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CLDN11O75508 207 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN19P0C672 248 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MAGEA2P43356 314 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A3P48764 834 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 DGKEP52429 567 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ABHD18Q0P651 414 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SLC14A1Q13336 389 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PLD1Q13393 1074 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZNF621Q6ZSS3 439 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KRT73Q86Y46 540 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CDC26Q8NHZ8 85 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ABCB9Q9NP78 766 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 AP3M1Q9Y2T2 418 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KLK4Q9Y5K2 254 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FABP12A6NFH5 140 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KLK8O60259 260 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GPX5O75715 221 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 C9P02748 559 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PRIM2P49643 509 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CLDN19Q8N6F1 224 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 B3GNT7Q8NFL0 401 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SPPL2AQ8TCT8 520 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RPS6KA6Q9UK32 745 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SELPP16109 830 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KDELR2P33947 212 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 SOX3P41225 446 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CLCN7P51798 805 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RAB25P57735 213 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZXDBP98169 803 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 UBE3AQ05086 875 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 HYAL2Q12891 473 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZNF79Q15937 498 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ANKS3Q6ZW76 656 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GLCCI1Q86VQ1 547 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 POLHQ9Y253 713 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC4Q9Y296 219 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 I3L521 148 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 BCKDHAP12694 445 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 POU1F1P28069 291 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GZMKP49863 264 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 RORCP51449 518 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 VEPH1Q14D04 833 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TATDN3Q17R31 274 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TOR2AQ5JU69 321 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LHX8Q68G74 356 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PMEPA1Q969W9 287 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CLMPQ9H6B4 373 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 FKBP14Q9NWM8 211 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 LHX3Q9UBR4 397 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 V9GYH0 126 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GVM2 712 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 OR7A10O76100 309 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CKMT1AP12532 417 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 GGT2P36268 569 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TTPAP49638 278 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ADGRF1Q5T601 910 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CDH24Q86UP0 819 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 CALHM3Q86XJ0 350 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 PLCZ1Q86YW0 608 aa12.97□□□□□ -0.33
NISCH-212ENST00000488380 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms