RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 KCNA7Q96RP8 456 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CMKLR1Q99788 373 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 VPS29Q9UBQ0 182 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FEZF1A0PJY2 475 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FITM1A5D6W6 292 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 B4E171 279 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ZNF195O14628 629 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PIP5K1BO14986 540 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MT-CO3P00414 261 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 KITP10721 976 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 DRD4P21917 467 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN7P41732 249 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GSTM5P46439 218 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ARSFP54793 590 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 BTKQ06187 659 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GRM7Q14831 915 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SPIN4Q56A73 249 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PHF19Q5T6S3 580 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 HES3Q5TGS1 186 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 EPGNQ6UW88 154 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GPR135Q8IZ08 494 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 AGR3Q8TD06 166 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PPM1MQ96MI6 270 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ZPBPQ9BS86 351 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MS4A8Q9BY19 250 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 B3GNT4Q9C0J1 378 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 KLHL3Q9UH77 587 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YVX5 310 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 LRIT2A6NDA9 550 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MAGEB17A8MXT2 336 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMEM233B4DJY2 109 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 H0YGG7 62 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NDUFS4O43181 175 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 HBQ1P09105 142 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MAPK1P28482 360 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB3P29508 390 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SEPHS1P49903 392 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SEC24CP53992 1094 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 AQP5P55064 265 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RAB15P59190 212 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CXADRP78310 365 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM53BQ14153 422 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ISXQ2M1V0 245 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 OGFOD2Q6N063 350 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ABHD13Q7L211 337 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SPATA21Q7Z572 469 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 OR2L5Q8NG80 312 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RGMAQ96B86 450 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MVB12AQ96EY5 273 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NUF2Q9BZD4 464 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TUBB1Q9H4B7 451 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CLMPQ9H6B4 373 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM60AQ9NP50 221 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NPHS2Q9NP85 383 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FGF21Q9NSA1 209 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 C1orf109Q9NX04 203 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ASIC5Q9NY37 505 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms