RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 PPP3R1P63098 170 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 CD47Q08722 323 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 CBX3Q13185 183 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 DOC2AQ14183 400 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFA5Q16718 116 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 NANOGP8Q6NSW7 305 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 OR4K14Q8NGD5 310 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 TOP1MTQ969P6 601 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 PYURFQ96I23 114 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 RANBP9Q96S59 729 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 COMMD4Q9H0A8 199 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 NANOGQ9H9S0 305 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 BRD7Q9NPI1 651 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 PEX12O00623 359 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 MID1O15344 667 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 PRKACGP22612 351 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 HOXC12P31275 282 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 VLDLRP98155 873 aa12.9□□□□□ -0.34
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HDLBP-241ENST00000487169 C5orf22Q49AR2 442 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 REEP3Q6NUK4 255 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 GALNT7Q86SF2 657 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 SYVN1Q86TM6 617 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 RNF130Q86XS8 419 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 LNX2Q8N448 690 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 OR5M3Q8NGP4 307 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.9□□□□□ -0.34
HDLBP-241ENST00000487169 OR5K4A6NMS3 321 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 H3BQ06 376 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 BCKDHAP12694 445 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 HSH2DQ96JZ2 352 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 KCNH6Q9H252 994 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PAPPAQ13219 1627 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FAM170BA6NMN3 283 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF726A6NNF4 738 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TOR1BO14657 336 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GSTM3P21266 225 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ACVR2AP27037 513 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 S100GP29377 79 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TBPL1P62380 186 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CST9Q5W186 159 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TSPEARQ8WU66 669 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CAPSLQ8WWF8 208 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PTCHD1Q96NR3 888 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TAS2R9Q9NYW1 312 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MAFFQ9ULX9 164 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 A0A075B6Q4 140 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf74A8MZ97 194 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 RCBTB2O95199 551 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS56P0CW18 603 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 JUNDP17535 347 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GM2AP17900 193 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 GALK1P51570 392 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 LAPTM4AQ15012 233 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 NPTX1Q15818 432 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 BICRALQ6AI39 1079 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 OR4K17Q8NGC6 315 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MAPK15Q8TD08 544 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FCGR1BQ92637 280 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FZD3Q9NPG1 666 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SDHAF3Q9NRP4 125 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MS4A12Q9NXJ0 267 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 POFUT2Q9Y2G5 429 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 OARD1Q9Y530 152 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 MC1RQ01726 317 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 11.3
HDLBP-241ENST00000487169 CLIP4Q8N3C7 705 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 PACRGLQ8N7B6 248 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 UFD1Q92890 307 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 BOCQ9BWV1 1114 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 TRPV5Q9NQA5 729 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 KLRF1Q9NZS2 232 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.89□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 CACNA1CQ13936 2221 aa12.88□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 FAM25EA8MYX2 175 aa12.88□□□□□ -0.35
HDLBP-241ENST00000487169 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
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