RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PDXPQ96GD0 296 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 METTL12A8MUP2 240 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GPIP06744 558 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GGT5P36269 586 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CENPAP49450 140 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NUP107P57740 925 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GRB7Q14451 532 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PTGR1Q14914 329 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SETD9Q8NE22 299 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LGR4Q9BXB1 951 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NEU3Q9UQ49 428 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TRBC2A0A5B9 178 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IFNW1P05000 195 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ENGP17813 658 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM73Q86UV7 250 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MR1Q95460 341 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MOAP1Q96BY2 351 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC30A3Q99726 388 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 APOL4Q9BPW4 351 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ACTL8Q9H568 366 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GAREM1Q9H706 876 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC3AO75596 197 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CD160O95971 181 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IL3P08700 152 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TEAD1P28347 426 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R41P59536 307 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SPIBQ01892 262 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SPESP1Q6UW49 350 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FAM13CQ8NE31 585 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF563Q8TA94 476 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 S1PR5Q9H228 398 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 P2RX2Q9UBL9 471 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 H0Y8X5 98 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 K7EQS6 105 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 BTN3A3O00478 584 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CXCR6O00574 342 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 FAM58BPP0C7Q3 252 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IMPA1P29218 277 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 HTR6P50406 440 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN8P56748 225 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 DSTNP60981 165 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 NR1D2Q14995 579 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CDKN3Q16667 212 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SBSNQ6UWP8 590 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.94□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 LCTP09848 1927 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 E7ENX8 843 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 UGT2B17O75795 530 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IL7RP16871 459 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CAPZA2P47755 286 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MASP1P48740 699 aa7.94□□□□□ -1.14
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