RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ELOVL6Q9H5J4 265 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF11BO00300 401 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TBL1XO60907 577 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RHOAP61586 193 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OLR1P78380 273 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 XKR7Q5GH72 579 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A12Q96S37 553 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TP53P04637 393 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CDKN2CP42773 168 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HK3P52790 923 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SPIBQ01892 262 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 APOLD1Q96LR9 279 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RIPOR3Q96MK2 946 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf42Q9H799 3197 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LCHNA4D1U4 455 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CDK1P06493 297 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA9P31269 272 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAPKAPK2P49137 400 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ESCO2Q56NI9 601 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MSRB3Q8IXL7 192 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TAGAPQ8N103 731 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAL2Q969L2 176 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MED16Q9Y2X0 877 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PDE9AO76083 593 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 APOL3O95236 402 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PKLRP30613 574 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA11P43364 429 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RORCP51449 518 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CAV3P56539 151 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SNX20Q7Z614 316 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 EGLN2Q96KS0 407 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DERL2Q9GZP9 239 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ARNTLO00327 626 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PRRG1O14668 218 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF250P15622 560 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SELPP16109 830 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SNAPC1Q16533 368 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 VWA5B2Q8N398 1253 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 POF1BQ8WVV4 589 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 BOCQ9BWV1 1114 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PDFQ9HBH1 243 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 STC2O76061 302 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 OTCP00480 354 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 C9P02748 559 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 INHAP05111 366 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GJA1P17302 382 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ENGP17813 658 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 DDCP20711 480 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 BNC1Q01954 994 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC12Q5T9G4 340 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 LIPKQ5VXJ0 399 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC190Q86UF4 302 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SLC5A8Q8N695 610 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 PSKH2Q96QS6 385 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-204ENST00000483092 GLTPQ9NZD2 209 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms