RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHF24Q9UPV7 400 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED31Q9Y3C7 131 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP6CO00743 305 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNA6P05013 189 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATCAYQ86WG3 371 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PREBQ9HCU5 417 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FDXRP22570 491 aa16.02■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCN7P51798 805 aa16.02■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMK1GQ96NX5 476 aa16.02■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX13Q92968 403 aa16.02■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.02■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSKH1P11801 424 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACRV1P26436 265 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDELR2P33947 212 aa16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC34A8MYJ7 566 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCB7O75027 752 aa16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IER5LQ5T953 404 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITPAQ9BY32 194 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.01■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.01■□□□□ 0.15
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACADLP28330 430 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STARP49675 285 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MLLT10P55197 1068 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVPABLB-1P60509 514 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF805Q5CZA5 627 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSDMCQ9BYG8 508 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TM9SF3Q9HD45 589 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB42B2RXF5 422 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NME4O00746 187 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNA5P22460 613 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REEP3Q6NUK4 255 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 REEP4Q9H6H4 257 aa16■□□□□ 0.15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16■□□□□ 0.15
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