RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 EMX2Q04743 252 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 UNC50Q53HI1 259 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 RAB43Q86YS6 212 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 FAM170BA6NMN3 283 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ARPC2O15144 300 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 H6PDO95479 791 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SERPINA1P01009 418 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 NCEH1Q6PIU2 408 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 AP3S1Q92572 193 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ZNF382Q96SR6 550 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ZNF222Q9UK12 451 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.17□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TTC34A8MYJ7 566 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CKMT2P17540 419 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 IKBIPQ70UQ0 350 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 IZUMO1Q8IYV9 350 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 KLF15Q9UIH9 416 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TGFB1P01137 390 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 THEGLP0DJG4 465 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 GSK3BP49841 420 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ATP4BP51164 291 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 KDELC1Q6UW63 502 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 APCDD1Q8J025 514 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 LRRC20Q8TCA0 184 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SCAMP4Q969E2 229 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 MGME1Q9BQP7 344 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 JUPP14923 745 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 GGT5P36269 586 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 RHDQ02161 417 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ACY1Q03154 408 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PYDC2Q56P42 97 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SVOPLQ8N434 492 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 OR4C6Q8NH72 309 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DUSP23Q9BVJ7 150 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DRGXA6NNA5 263 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 A8MUA0 341 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CCNB2O95067 398 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 OMPP47874 163 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DIO3P55073 304 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SRP54P61011 504 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 RAPSNQ13702 412 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SNAPC1Q16533 368 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TCTE1Q5JU00 501 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 LINC00471Q8N535 108 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 OR6C4Q8NGE1 309 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ZNF224Q9NZL3 707 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 G3V2L1 256 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TSPAN4O14817 238 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PRAMEF12O95522 483 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ETV3P41162 512 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CTSKP43235 329 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DSC3Q14574 896 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 KCTD8Q6ZWB6 473 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 CRISPLD1Q9H336 500 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SP140LQ9H930 580 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 BCKDKO14874 412 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 C6P13671 934 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ACRV1P26436 265 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ASPGQ86U10 573 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ACTR3BQ9P1U1 418 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 DKKL1Q9UK85 242 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 PGRP06401 933 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ADRB3P13945 408 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 ARSFP54793 590 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 SLC7A9P82251 487 aa13.15□□□□□ -0.3
NISCH-207ENST00000479054 FGL2Q14314 439 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms