RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 GAB1Q13480 694 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SPIDRQ14159 915 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KRT78Q8N1N4 520 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PITX2Q99697 317 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SH2B3Q9UQQ2 575 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF682O95780 498 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OPRD1P41143 372 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 KCNJ10P78508 379 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CD47Q08722 323 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DMPKQ09013 629 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PNCKQ6P2M8 343 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR4A15Q8NGL6 344 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 H3BMQ9 156 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 BCKDKO14874 412 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CDK4P11802 303 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ITIH1P19827 911 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CRYBA2P53672 197 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF385BQ569K4 471 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TRIM74Q86UV6 250 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SPARTQ8N0X7 666 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SUSD6Q92537 303 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SNX19Q92543 992 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 COG8Q96MW5 612 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DOHHQ9BU89 302 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 EBF1Q9UH73 591 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM229AB2RXF0 380 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 DAPP51397 102 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 VLDLRP98155 873 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 NFE2L1Q14494 772 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 OR5K2Q8NHB8 316 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 FGF13Q92913 245 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 PSD2Q9BQI7 771 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 THSD1Q9NS62 852 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 BAG5Q9UL15 447 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRF-212ENST00000477970 SLC1A7O00341 560 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 C9P02748 559 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CXCR2P25025 360 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 IL12RB1P42701 662 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SELENOWP63302 87 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 HYAL1Q12794 435 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 METRNLQ641Q3 311 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 AMZ2Q86W34 360 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GAB3Q8WWW8 586 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MUL1Q969V5 352 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF347Q96SE7 839 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 TEX101Q9BY14 249 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 AHSPQ9NZD4 102 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SZT2Q5T011 3432 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 SUV39H1O43463 412 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 C1QCP02747 245 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CDK5R2Q13319 367 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ADAM15Q13444 863 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 STARD3Q14849 445 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CEP68Q76N32 757 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 HORMAD1Q86X24 394 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 PPCDCQ96CD2 204 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 MENTQ9BUN1 341 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 REEP1Q9H902 201 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 HCN2Q9UL51 889 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 CKAP5Q14008 2032 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRF-212ENST00000477970 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms