RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10A4Q9H209 315 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TREM1Q9NP99 234 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 EXD2Q9NVH0 621 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.06□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PQU0 124 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 BLACEA4D250 179 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR171O14626 319 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TOR1AO14656 332 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PTP4A3O75365 173 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM107AO95990 144 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGB2P05107 769 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 HLA-DQB2P05538 268 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 JMJD7P0C870 316 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ITGALP20701 1170 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CHMP24386 653 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PTPN7P35236 360 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 SPAM1P38567 509 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MMP13P45452 471 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PRRX1P54821 245 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 NR1H2P55055 460 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 AP1S1P61966 158 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GLO1Q04760 184 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRAF2Q12933 501 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 FGL2Q14314 439 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF284Q2VY69 593 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 NPNTQ6UXI9 565 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 RTL4Q6ZR62 310 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT78Q8N1N4 520 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GIPC3Q8TF64 312 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PTP4A1Q93096 173 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNJ15Q99712 375 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC22A4Q9H015 551 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 S100A14Q9HCY8 104 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 DYRK4Q9NR20 520 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.05□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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RPUSD3-212ENST00000466141 RP1P56715 2156 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PPL8 197 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MATN3O15232 486 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 GPRIN2O60269 458 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CST8O60676 142 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CDH16O75309 829 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB3DO95716 219 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 FTCDO95954 541 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 NR2F1P10589 423 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 F8A1P23610 371 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPINA4P29622 427 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MMP12P39900 470 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CCR10P46092 362 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 MAPK10P53779 464 aa7.04□□□□□ -1.28
RPUSD3-212ENST00000466141 CASP9P55211 416 aa7.04□□□□□ -1.28
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