RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440360.1

RPS29P9-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P9, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P9-201ENST00000440360 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MNAT1P51948 309 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 OR1D5P58170 312 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CYP4F2P78329 520 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 HSD11B2P80365 405 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RGS1Q08116 209 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TGM3Q08188 693 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CYP4F3Q08477 520 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 BNIP1Q12981 228 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PTGR1Q14914 329 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MAPRE2Q15555 327 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TCTE1Q5JU00 501 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PERM1Q5SV97 790 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CACHD1Q5VU97 1274 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 NXNQ6DKJ4 435 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 IRGCQ6NXR0 463 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PRR23CQ6ZRP0 262 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ABHD13Q7L211 337 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 GLRX5Q86SX6 157 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PIP4P1Q86T03 277 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TREML1Q86YW5 311 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RIMKLAQ8IXN7 391 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 EID2Q8N6I1 236 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 OR8K5Q8NH50 307 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 IFI44Q8TCB0 444 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MS4A6EQ96DS6 147 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CMTM5Q96DZ9 223 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MVB12AQ96EY5 273 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 APIPQ96GX9 242 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PPP1R36Q96LQ0 422 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PPM1MQ96MI6 270 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 QRFPRQ96P65 431 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TGM7Q96PF1 710 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PHOX2BQ99453 314 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CDC6Q99741 560 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MAP3K3Q99759 626 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 C1orf50Q9BV19 199 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 LRMDAQ9H2I8 198 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CLMPQ9H6B4 373 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 AHSPQ9NZD4 102 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 EHD3Q9NZN3 535 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ARMCX1Q9P291 453 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 ADAMTS20P59510 1910 aa4.8□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 A0A088AWK7 358 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FEZF1A0PJY2 475 aa4.79□□□□□ -1.64
RPS29P9-201ENST00000440360 FAM234BA2RU67 622 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms