RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MPEG1Q2M385 716 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RNF220Q5VTB9 566 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 FAM71E1Q6IPT2 247 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 Q6ZS52 159 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 FAM3CQ92520 227 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 DNASE1L2Q92874 299 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MYNNQ9NPC7 610 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf226A1L170 272 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf47O95873 294 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 IST1P53990 364 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 HBA1P69905 142 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CSNK1G2P78368 415 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PTOV1Q86YD1 416 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ZZZ3Q8IYH5 903 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PACRGLQ8N7B6 248 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MS4A8Q9BY19 250 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 UPK1AO00322 258 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 GNAO1P09471 354 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 NFATC4Q14934 902 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.144e-7■■■■■ 40
FAAP20-209ENST00000428120 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 GPR155Q7Z3F1 870 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PGBD3Q8N328 593 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TMBIM1Q969X1 311 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PDP2Q9P2J9 529 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0G2JN53 185 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF682O95780 498 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1024LP59773 190 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CTBSQ01459 385 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ADRM1Q16186 407 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CARM1Q86X55 608 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 EBF1Q9UH73 591 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 VPS4AQ9UN37 437 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K13O43283 966 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PDE7AQ13946 482 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 VMACQ2NL98 169 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP90Q8TF47 636 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TFAP2CQ92754 450 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MAL2Q969L2 176 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GTW7 788 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 CST1P01037 141 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM69Q86WT6 500 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ASB12Q8WXK4 309 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 WDR92Q96MX6 357 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PHF12Q96QT6 1004 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ABCG4Q9H172 646 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MVB12BQ9H7P6 319 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1DO15297 605 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ13O60928 360 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 BSGP35613 385 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 FRMD1Q8N878 549 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 ADI1Q9BV57 179 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 YY1AP1Q9H869 796 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 AHSPQ9NZD4 102 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC72A6NJI9 287 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 RASGRP1O95267 797 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK12P53778 367 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 VAC14Q08AM6 782 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL6Q8N531 539 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms