RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MEP1BQ16820 701 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CCDC158Q5M9N0 1113 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PODNL1Q6PEZ8 512 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 DOK6Q6PKX4 331 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 GBP6Q6ZN66 633 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SMYD1Q8NB12 490 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CASP10Q92851 521 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 AGAP4Q96P64 663 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ATG101Q9BSB4 218 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 VPS18Q9P253 973 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 GPR132Q9UNW8 380 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SATB2Q9UPW6 733 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.57□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ILVBLA1L0T0 632 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 G3V2L1 256 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SLC7A4O43246 635 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 IDH3BO43837 385 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TMEM50BP56557 158 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CETN1Q12798 172 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 NFATC2Q13469 925 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 C2CD6Q53TS8 623 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 MACC1Q6ZN28 852 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TUSC5Q8IXB3 177 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 METTL4Q8N3J2 472 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TEX26Q8N6G2 289 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 Q8NBF4 154 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 AFAP1L1Q8TED9 768 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PKP2Q99959 881 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SLC39A8Q9C0K1 460 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TMEM206Q9H813 350 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.56□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CACNA1FO60840 1977 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 E9PQ18 207 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SOCS3O14543 225 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 STX6O43752 255 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 LRCH4O75427 683 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 AOC1P19801 751 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ITIH1P19827 911 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 C4BPBP20851 252 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CTNNA2P26232 953 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 GIFP27352 417 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SRD5A2P31213 254 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 KRT2P35908 639 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PPA1Q15181 289 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CCDC185Q8N715 623 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 AMER3Q8N944 861 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 OR7G3Q8NG95 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 GDAP1Q8TB36 358 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SAP25Q8TEE9 199 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 CKAP2Q8WWK9 683 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 DESI2Q9BSY9 194 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 LRRC61Q9BV99 259 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.55□□□□□ -1.84
RBM39-211ENST00000426951 NDE1Q9NXR1 346 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms