RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412585.6

HLA-B-249, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HLA-B, Length 1,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-249ENST00000412585 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 H7BY64 318 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 OR7A17O14581 309 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TM4SF5O14894 197 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 NRP2O60462 931 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 LINGO3P0C6S8 592 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 EBLN1P0CF75 366 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PVRP15151 417 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ST6GAL1P15907 406 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 EPORP19235 508 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HNF4AP41235 474 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ERFP50548 548 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CLCN2P51788 898 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 XKR7Q5GH72 579 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PHF19Q5T6S3 580 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 LIPJQ5W064 366 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KRT78Q8N1N4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 UBE2E3Q969T4 207 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CCDC74BQ96LY2 380 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PPM1MQ96MI6 270 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TMEM74Q96NL1 305 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 VCXQ9H320 206 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.94■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 DPPA5A6NC42 116 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 MRASO14807 208 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PIP5K1BO14986 540 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 UQCRBP14927 111 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 LSSP48449 732 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PCDH1Q08174 1060 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TRAF3Q13114 568 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 DOC2AQ14183 400 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SPATS1Q496A3 300 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 LPCAT4Q643R3 524 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 GRHL2Q6ISB3 625 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF425Q6IV72 752 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HOMEZQ8IX15 550 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 WDR34Q96EX3 536 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TCTN2Q96GX1 697 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KCNA7Q96RP8 456 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PDE7BQ9NP56 450 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PDP2Q9P2J9 529 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.93■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 OR2A25A4D2G3 310 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 A8MU76 341 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 OR4F21O95013 312 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 UROSP10746 265 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 LBPP18428 481 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 PLA2G5P39877 138 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CASP2P42575 452 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 SEPHS1P49903 392 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 STX1BP61266 288 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 CSNK1G2P78368 415 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 HSD11B2P80365 405 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 REEP5Q00765 189 aa15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HLA-B-249ENST00000412585 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms