RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.75□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PDYNP01213 254 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GNAO1P09471 354 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CD1DP15813 335 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GSTM3P21266 225 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LCN1P31025 176 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 LSAMPQ13449 338 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 UNC50Q53HI1 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 HERVK_113Q902F9 699 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCG4Q9H172 646 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLIT2O94813 1529 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DLGAP1O14490 977 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 RLN2P04090 185 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 STSP08842 583 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC6A9P48067 706 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC15A4Q8N697 577 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF878C9JN71 531 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CHRNA1P02708 482 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CELP19835 753 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NCS1P62166 190 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 C22orf42Q6IC83 251 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC107Q8WV48 283 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TEX46H3BTG2 121 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ACTR1BP42025 376 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ACTR1AP61163 376 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SEMA3AQ14563 771 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TNFRSF10BO14763 440 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF208O43345 1280 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ADH7P40394 386 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ASRGL1Q7L266 308 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 NRG4Q8WWG1 115 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MSRAQ9UJ68 235 aa14.74□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MMP20O60882 483 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TACSTD2P09758 323 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PTPN2P17706 415 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SCNN1AP37088 669 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GRK1Q15835 563 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 MMP27Q9H306 513 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 PROM1O43490 865 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 OR7A10O76100 309 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 FGF19O95750 216 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 SOX2P48431 317 aa14.73□□□□□ -0.05
PTGFRN-201ENST00000393203 GINS1Q14691 196 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms