RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 EPYCQ99645 322 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TTPALQ9BTX7 342 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CD274Q9NZQ7 290 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VAPAQ9P0L0 249 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPASTQ9UBP0 616 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM22Q9Y584 194 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRDP23468 1912 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SH3D21A4FU49 640 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC182A6NF36 153 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLCA1A8K7I4 914 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 VSTM5A8MXK1 200 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 I6L893 689 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 B4GALT3O60512 393 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 BEST1O76090 585 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C9P02748 559 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ADH5P11766 374 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRPS2P11908 318 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH4A1P30038 563 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CD86P42081 329 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2K3P46734 347 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 GNPDA1P46926 289 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 P2RX3P56373 397 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CREMQ03060 361 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NPRL3Q12980 569 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NEK5Q6P3R8 708 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FAHD1Q6P587 224 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZSR9 355 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 AHSA2Q719I0 299 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NOXA1Q86UR1 476 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CMIPQ8IY22 773 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF675Q8TD23 568 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ9Q92806 393 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM169Q96HH4 297 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF21Q96ID5 467 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 WDFY2Q96P53 400 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR52E6Q96RD3 313 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PKMYT1Q99640 499 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 FOXQ1Q9C009 403 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SIK2Q9H0K1 926 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLMPQ9H6B4 373 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CWH43Q9H720 699 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NT5MQ9NPB1 228 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 MARCH5Q9NX47 278 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PHF11Q9UIL8 331 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 STUB1Q9UNE7 303 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SNX7Q9UNH6 387 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NEU3Q9UQ49 428 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PATJQ8NI35 1801 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ALPK3Q96L96 1907 aa6.94□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf81A6NN90 581 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 E9PAM4 449 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN5O00501 218 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PPP6CO00743 305 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 HCRTO43612 131 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 TMCC2O75069 709 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 OR4F21O95013 312 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 EPN2O95208 641 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 CAPN1P07384 714 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA3P25788 255 aa6.93□□□□□ -1.3
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB8P26012 769 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms