RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326181.10

TRAF7-201, Transcript of TNF receptor associated factor 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF7, Length 3,700 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7-201ENST00000326181 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 IFT52Q9Y366 437 aa14.58□□□□□ -0.07
TRAF7-201ENST00000326181 KPNA5O15131 536 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ADAMDEC1O15204 470 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TGFB1P01137 390 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SLC10A3P09131 477 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 HNMTP50135 292 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 MTAPQ13126 283 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 STARD3Q14849 445 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TRIM60Q495X7 471 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 PKP4Q99569 1192 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SP140LQ9H930 580 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SLC6A12P48065 614 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SELENOWP63302 87 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 HBA1P69905 142 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SCARB2Q14108 478 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 IFI44LQ53G44 452 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 COL21A1Q96P44 957 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 FAM129BQ96TA1 746 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 EPYCQ99645 322 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 PITX2Q99697 317 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 NEK6Q9HC98 313 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.58□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 NUAK1O60285 661 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TGM4P49221 684 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 Q6ZVL8 140 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 Q6ZVU0 165 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TTC36A6NLP5 189 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SOX3P41225 446 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CASP3P42574 277 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SZRD1Q7Z422 152 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 RNF130Q86XS8 419 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CHST14Q8NCH0 376 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SCRN2Q96FV2 425 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SAMD11Q96NU1 681 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 MGLLQ99685 303 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ISPDA4D126 451 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ZW10O43264 779 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SEMG1P04279 462 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CAP1Q01518 475 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ZNF385BQ569K4 471 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 PNCKQ6P2M8 343 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 OR51B5Q9H339 312 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SLC16A8O95907 504 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 GABRR2P28476 465 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 WEE1P30291 646 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 VEZF1Q14119 521 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SLC34A3Q8N130 599 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TMEM159Q96B96 161 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 H3BN98 237 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TAF4O00268 1085 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 AP3D1O14617 1153 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 GADD45GO95257 159 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 IGHA2P01877 340 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 C1SP09871 688 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TCTN1Q2MV58 587 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 RMI1Q9H9A7 625 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF7-201ENST00000326181 HAT1O14929 419 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms