RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 OLAHQ9NV23 265 aa14.36□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 OARD1Q9Y530 152 aa14.36□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 A8MUI8 341 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PRAMEF4O60810 478 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 IL10P22301 178 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SSTR1P30872 391 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 DCTP40126 519 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 GDF5P43026 501 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 BTG2P78543 158 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SFT2D3Q587I9 215 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 BEST3Q8N1M1 668 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 RHOJQ9H4E5 214 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PELI2Q9HAT8 420 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 MMP25Q9NPA2 562 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.35□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 FAM227AF5H4B4 570 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PRAMEF2O60811 474 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SERPIND1P05546 499 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 FHP07954 510 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 CD96P40200 585 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 HNF4AP41235 474 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 PAFAH1B1P43034 410 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SLC6A12P48065 614 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 RAB8AP61006 207 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 AP2B1P63010 937 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 INAQ16352 499 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 EXT1Q16394 746 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 MDS2Q8NDY4 140 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 ELP5Q8TE02 316 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 VPS39Q96JC1 886 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 HES7Q9BYE0 225 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 KCNK13Q9HB14 408 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 ABI3Q9P2A4 366 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 RNF14Q9UBS8 474 aa14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 LRBAP50851 2863 aa14.33□□□□□ -0.11
CTSW-201ENST00000307886 TAPBPO15533 448 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZG16O60844 167 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 B4GALT2O60909 372 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 RASAL1O95294 804 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 GMPRP36959 345 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 SLC26A5P58743 744 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 PMP22Q01453 160 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TUBA3CQ13748 450 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TRPV3Q8NET8 790 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 RELTQ969Z4 430 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ERP44Q9BS26 406 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.33□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 RAD51CO43502 376 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 SERPINA6P08185 405 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 MAOAP21397 527 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 KCNC1P48547 511 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 OR4D2P58180 307 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 GPX6P59796 221 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 RGS1Q08116 209 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TGFBIQ15582 683 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 TRADDQ15628 312 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZNF766Q5HY98 468 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 CYS1Q717R9 158 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ABHD13Q7L211 337 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 FJX1Q86VR8 437 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.32□□□□□ -0.12
CTSW-201ENST00000307886 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms