RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.64■□□□□ 0.9
MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PP55 124 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CXCR6O00574 342 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HSD3B1P14060 373 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HSD3B2P26439 372 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PTPN6P29350 595 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 TAP2Q03519 686 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PCDH1Q08174 1060 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SPCS2Q15005 226 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 INAVAQ3KP66 663 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ATG9BQ674R7 924 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MICU2Q8IYU8 434 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SNAP29O95721 258 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PNLIPRP1P54315 467 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 AMZ2Q86W34 360 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HHIPQ96QV1 700 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SGPP1Q9BX95 441 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.64■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 KRT75O95678 551 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ALBP02768 609 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 TIE1P35590 1138 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CHRNB3Q05901 458 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DMPKQ09013 629 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MTAPQ13126 283 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DNASE1L3Q13609 305 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 FKBP10Q96AY3 582 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PANX1Q96RD7 426 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PRR23AA6NEV1 266 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 FPGTO14772 594 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 C1QCP02747 245 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 RAP2AP10114 183 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 LAMP2P13473 410 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 IFITM3Q01628 133 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SLC14A1Q13336 389 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 HKDC1Q2TB90 917 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 KLK6Q92876 244 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 OR1A2Q9Y585 309 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.63■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 RGS13O14921 159 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 UGT2B11O75310 529 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DNAJB5O75953 348 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 NTRK1P04629 796 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ELK4P28324 431 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PDZD3Q86UT5 571 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 REPS1Q96D71 796 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 NRTNQ99748 197 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 ING2Q9H160 280 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SPNS1Q9H2V7 528 aa20.62■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PIPSLA2A3N6 862 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PRMT3O60678 531 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 LAMP1P11279 417 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 PCSK2P16519 638 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 SERPINB1P30740 379 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 AQP6Q13520 282 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 E2F2Q14209 437 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 C2orf27AQ580R0 203 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.61■□□□□ 0.89
MESP1-201ENST00000300057 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms