RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 KBTBD6Q86V97 674 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SNX27Q96L92 541 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 hCG_2039718K7EN88 272 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 CXCR6O00574 342 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 HRH2P25021 359 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 APLNRP35414 380 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TRAM1Q15629 374 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RARRES3Q9UL19 164 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 IFT172Q9UG01 1749 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FGF18O76093 207 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 H2BFMP0C1H6 154 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 GK5Q6ZS86 529 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 DDIT4LQ96D03 193 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ACSS2Q9NR19 701 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ADRB2P07550 413 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 F8A1P23610 371 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TNFRSF8P28908 595 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 OR4K14Q8NGD5 310 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 NDNFQ8TB73 568 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 A8MVJ9 347 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MPP1Q00013 466 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 P2RY8Q86VZ1 359 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PROKR1Q8TCW9 393 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SPTSSAQ969W0 71 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 COL21A1Q96P44 957 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TTYH2Q9BSA4 534 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FBXW11Q9UKB1 542 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 NPC1O15118 1278 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ABOP16442 354 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RNF111Q6ZNA4 994 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ADAMTS4O75173 837 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MAGEA3P43357 314 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RAB12Q6IQ22 244 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TMED4Q7Z7H5 227 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FAM47BQ8NA70 645 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FAXDC2Q96IV6 333 aa16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MAP2K7O14733 419 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SLC34A2O95436 690 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ALDOBP05062 364 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SPOCK2Q92563 424 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FBRSQ9HAH7 460 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MOB2Q70IA6 237 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 NXNL1Q96CM4 212 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MFSD11O43934 449 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TUBG1P23258 451 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SLC3A1Q07837 685 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FSTL1Q12841 308 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 REP15Q6BDI9 236 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ATE1O95260 518 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FANK1Q8TC84 345 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 EURLQ9NYK6 297 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TREM1Q9NP99 234 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 APOL3O95236 402 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 MROQ9BYG7 248 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 GKN1Q9NS71 199 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.99■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 NOMO3P69849 1222 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PGAM5Q96HS1 289 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TAC3Q9UHF0 121 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa15.98■□□□□ 0.15
USP13-201ENST00000263966 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms