RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 FGBP02675 491 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 STAG3L3P0CL85 134 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CYP2D6P10635 497 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ETFAP13804 333 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KCNJ2P63252 427 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PMP22Q01453 160 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NHLH2Q02577 135 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 XRCC4Q13426 336 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GAB1Q13480 694 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TSC22D1Q15714 1073 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SBK1Q52WX2 424 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RNF43Q68DV7 783 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SIGIRRQ6IA17 410 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM65Q6PI78 240 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 S100ZQ8WXG8 99 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RFT1Q96AA3 541 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DYNLL2Q96FJ2 89 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NUDT11Q96G61 164 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF607Q96SK3 696 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 VAT1Q99536 393 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NUAK2Q9H093 628 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EURLQ9NYK6 297 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM2Q9UHN6 1383 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MYADML2A6NDP7 307 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 F8VZ95 297 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 XRCC3O43542 346 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 IDH3BO43837 385 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SELENOFO60613 162 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 IL1BP01584 269 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 HLA-DRAP01903 254 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LCATP04180 440 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 COMTP21964 271 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ME2P23368 584 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PSMB9P28065 219 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CRABP2P29373 138 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SSTR1P30872 391 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ETV1P50549 477 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 C21orf59P57076 290 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PTENP60484 403 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPS6P62753 249 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RHAGQ02094 409 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PGM5Q15124 567 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NOTUMQ6P988 496 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MAGEC3Q8TD91 643 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DPF1Q92782 380 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 FKBP10Q96AY3 582 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MS4A14Q96JA4 679 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MNTQ99583 582 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DPY30Q9C005 99 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LY9Q9HBG7 655 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ASB3Q9Y575 518 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATP10AO60312 1499 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 A0A1B0GVM2 712 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 E5RGE8 158 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 F5H5T6 163 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RAD51BO15315 384 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SUV39H1O43463 412 aa3.53□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RAD51CO43502 376 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms