RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GKN3PP0CG01 181 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF84P51523 738 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GPR143P51810 404 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DGKEP52429 567 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CCINQ13939 588 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RAB39AQ14964 217 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 REEP3Q6NUK4 255 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HMGB4Q8WW32 186 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NPY6RQ99463 290 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF69Q9UC07 566 aa6.99□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 M0QX08 132 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CCL22O00626 93 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAN2B1O00754 1011 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA12O60330 932 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PIAS1O75925 651 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MT-ND2P03891 347 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 YES1P07947 543 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GLDCP23378 1020 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ACRV1P26436 265 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RYKP34925 604 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CLCNKAP51800 687 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KCNC4Q03721 635 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ARFRP1Q13795 201 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 EML3Q32P44 896 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GXYLT1Q4G148 440 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ELP5Q8TE02 316 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TIGARQ9NQ88 270 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LIPT1Q9Y234 373 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MTMR11A4FU01 709 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 UNC119BA6NIH7 251 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 POU2F1P14859 743 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 IL1R2P27930 398 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NFATC2Q13469 925 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NFE2L1Q14494 772 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RHEBQ15382 184 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 GPR68Q15743 365 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 COQ5Q5HYK3 327 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RNF220Q5VTB9 566 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PMEPA1Q969W9 287 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TM9SF2Q99805 663 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TPK1Q9H3S4 243 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 A0A075B6Q4 140 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DPPA5A6NC42 116 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 LRRN3E7EW58 273 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 CDC7O00311 574 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 DLGAP1O14490 977 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 TBX1O43435 398 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 ABCB7O75027 752 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HBQ1P09105 142 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 HOXB2P14652 356 aa6.98□□□□□ -1.29
CPS1-201ENST00000233072 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms