RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gbp10Q000W5 611 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr813Q7TRH5 310 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q8BHB7 409 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm9881Q8BR56 211 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ikzf5Q8BU00 419 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp6v1hQ8BVE3 483 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pp2d1Q8BVT6 620 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Batf2Q8R1H8 277 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cts7Q91ZF2 331 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gkn2Q9CQS6 184 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HhatlQ9D1G3 503 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm29797A0A140LIA7 188 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SrsxB2RZI1 361 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn2r12L7N217 831 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cacng1O70578 223 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01654 111 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01656 111 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mtnd5P03921 607 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P03977 111 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxd11P23813 323 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nol9Q3TZX8 714 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmed1Q3V009 227 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp22Q5DU02 525 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q8BHR8 331 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdh7Q8BM92 785 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sall4Q8BX22 1067 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bbs4Q8C1Z7 520 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr809Q8VEX8 328 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dennd2dQ91VV4 469 aa19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf39A2RT81 352 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lipo4D3Z608 396 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psmb5O55234 264 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnao1P18872 354 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ap5b1Q3TAP4 876 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rars2Q3U186 578 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gngt2Q61017 69 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 KdsrQ6GV12 332 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q8BL95 290 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dusp15Q8R4V2 235 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr666Q8VH00 318 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Impa2Q91UZ5 290 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Asb9Q91ZT8 290 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 C1qtnf2Q9D8U4 294 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pop7Q9DCH2 140 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TrioQ0KL02 3102 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cfap77A0A087WRI3 283 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aldoart2A6ZI47 364 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp599E9PWP1 548 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14139F6ZS36 494 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6502L7N456 481 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lhx8O35652 367 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnmt3bO88509 859 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Etv4P28322 485 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ephx2P34914 554 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AnpepP97449 966 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smad4P97471 551 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AptxQ7TQC5 342 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr986Q8VFN6 312 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arrb2Q91YI4 410 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrm1Q99J25 320 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4930519G04RikQ9CPT7 205 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmprss6Q9DBI0 811 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fads3Q9JJE7 449 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AgtrapQ9WVK0 161 aa19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plce1Q8K4S1 2282 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PpigA2AR02 752 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ephb6O08644 1014 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc16a8O35308 492 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tssk2O54863 358 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lgals7O54974 136 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 H2-Q8P14430 326 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Srp54P14576 504 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bmp8aP34821 399 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cr1lQ64735 483 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr128Q7TRJ1 308 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tprg1Q8CB49 279 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajc27Q8CFP6 273 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Noxo1Q8VCM2 349 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myg1Q9JK81 380 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arpc3Q9JM76 178 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Khdrbs2Q9WU01 349 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Srd5a3Q9WUP4 330 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fer1l5P0DM40 2038 aa19.18■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm13040A2A8C4 496 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc28a1E9PXX9 648 aa19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5861F6VCN9 180 aa19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms