RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EdaraddQ8VHX2 208 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc22a7Q91WU2 540 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D1K7 174 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mcemp1Q9D8U6 183 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh6a1Q9EQ20 535 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 IL36RNQ9QYY1 156 aa17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3159K7N760 267 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6356L7N2A7 188 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptch2O35595 1182 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cer1O55233 272 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SqleP52019 572 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PdxpP60487 292 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pla2g5P97391 137 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpat2Q14DK4 801 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf43Q5NCP0 784 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp1b1Q64429 543 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr503Q7TRU8 323 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Carnmt1Q80UY1 400 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ebf4Q8K4J2 599 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps4aQ8VEJ9 437 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4f3Q99N16 524 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim33Q99PP7 1142 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrepQ9QUR6 710 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 B4galt6Q9WVK5 382 aa17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa17.46■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlrp1bA1Z198 1177 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Man1b1A2AJ15 658 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 H2-T24F8VQG4 363 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm2888K7N746 267 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gstm6O35660 218 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nid1P10493 1245 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PahP16331 453 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anxa4P97429 319 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd80Q00609 306 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q5EBG8 199 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fzd4Q61088 537 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ThrspQ62264 150 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pou4f2Q63934 411 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem125Q8CHQ6 216 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eva1bQ8K2Y3 164 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Guca1bQ8VBV8 201 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NrmQ8VC65 262 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SelenomQ8VHC3 145 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timm50Q9D880 353 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad21l1A2AU37 552 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 L3mbtl4B1B1A0 621 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Crisp4E9PVG4 293 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hax1O35387 280 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ChadO55226 358 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Idh2P54071 452 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VldlrP98156 873 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prss57Q14B24 284 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xrra1Q3U3V8 786 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r14bQ62084 147 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HjurpQ6PG16 667 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1308Q7TQX0 320 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Reep1Q8BGH4 201 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tigd4Q8BUZ3 513 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HopxQ8R1H0 73 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhb21Q91V48 774 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klk6Q91Y82 253 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FopnlQ9CZS3 174 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hyal6Q9D4E9 494 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PudpQ9D5U5 234 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec2gQ9D676 269 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fundc2Q9D6K8 151 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RtcAQ9D7H3 366 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dyrk1bQ9Z188 629 aa17.45■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mup18A2BIM8 181 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pramef20B1ARV6 477 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tulp3O88413 460 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mup11P04938 181 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adh5P28474 374 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab23P35288 237 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbpl1P62340 186 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NrtnP97463 195 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21320Q4FZE8 181 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bpifb1Q61114 474 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptpn18Q61152 453 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Angptl1Q640P2 490 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr128Q7TRJ1 308 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp418Q8BFS8 652 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr171Q8BG55 319 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bbs4Q8C1Z7 520 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa17.44■□□□□ 0.38
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr850Q8VFF2 315 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms