RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SFI1	A8K8P3	1242 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	IL2RA	P01589	272 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC13	P55735	322 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF358	Q9NW07	568 aa		7.35	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINT1	O43278	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP1	P13497	986 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	CLN3	Q13286	438 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	XP32	Q5T750	250 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	CNKSR1	Q969H4	720 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.34	□□□□□ -1.23
EFHC1-223	ENST00000636616	MEN1	O00255	615 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP2	P12643	396 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	DACH1	Q9UI36	760 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		7.34	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R2N6	131 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	BACH1	O14867	736 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SCARF1	Q14162	830 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP3	Q96P20	1036 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.33	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SSFA2	P28290	1259 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		7.32	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	VAMP1	P23763	118 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SMTN	P53814	917 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPC	Q03188	943 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	GPC1	P35052	558 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	TNS4	Q8IZW8	715 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NJY4	79 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINB4	P48594	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	MTFR1	Q15390	333 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHA4	P54764	986 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	TLR1	Q15399	786 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	UBXN4	Q92575	508 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	LGR5	O75473	907 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.28	□□□□□ -1.24
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	RECK	O95980	971 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXK2	Q01167	660 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.26	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		7.25	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	C21orf2	O43822	256 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PRMT3	O60678	531 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	WEE1	P30291	646 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		7.24	□□□□□ -1.25
EFHC1-223	ENST00000636616	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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