RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
EP300-208	ENST00000635538	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
EP300-208	ENST00000635538	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
EP300-208	ENST00000635538	SPINT1	O43278	529 aa		7.77	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	NPR3	P17342	541 aa		7.77	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.77	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	EML1	O00423	815 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	NOS2	P35228	1153 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	HIF1A	Q16665	826 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	RTN1	Q16799	776 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ABTB2	Q8N961	1025 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	AVP	P01185	164 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	WDR44	Q5JSH3	913 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	STIM2	Q9P246	746 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.73	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	SCARF1	Q14162	830 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	COX20	Q5RI15	118 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		7.72	□□□□□ -1.17
EP300-208	ENST00000635538	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	NDUFB5	O43674	189 aa		7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	BMP2	P12643	396 aa		7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	MAPK1	P28482	360 aa		7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	DGAT1	O75907	488 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	MPST	P25325	297 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	ECM1	Q16610	540 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	NGLY1	Q96IV0	654 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		7.7	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	COL19A1	Q14993	1142 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		7.69	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	LAPTM4A	Q15012	233 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	RNF217	Q8TC41	542 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		7.68	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	TTLL8	A6PVC2	850 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	USP5	P45974	858 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	AAMP	Q13685	434 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		7.67	□□□□□ -1.18
EP300-208	ENST00000635538	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		7.67	□□□□□ -1.18

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