RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614085.1

U1.25-201, humanhuman

BASIC

Gene U1, Length 162 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U1.25-201ENST00000614085 RAD50Q92878 1312 aa7.41□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 SBNO1A3KN83 1393 aa7.41□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 USP6P35125 1406 aa7.41□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 SYCE3A1L190 88 aa7.4□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 CAVIN2O95810 425 aa7.4□□□□□ -1.22
U1.25-201ENST00000614085 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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U1.25-201ENST00000614085 ATP8B2P98198 1209 aa7.4□□□□□ -1.22
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U1.25-201ENST00000614085 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
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U1.25-201ENST00000614085 STK31Q9BXU1 1019 aa7.4□□□□□ -1.22
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U1.25-201ENST00000614085 PKP1Q13835 747 aa7.39□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.38□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 FAM193AP78312 1265 aa7.38□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.38□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 POLA2Q14181 598 aa7.36□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 SNRKQ9NRH2 765 aa7.36□□□□□ -1.23
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U1.25-201ENST00000614085 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.36□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 METP08581 1390 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 STX6O43752 255 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 NEMFO60524 1076 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 IGSF3O75054 1194 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 F13A1P00488 732 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 DMTNQ08495 405 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 FLIIQ13045 1269 aa7.35□□□□□ -1.23
U1.25-201ENST00000614085 ANKRD1Q15327 319 aa7.35□□□□□ -1.23
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