RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MUC1-222	ENST00000610468	NFIX	Q14938	502 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MUC1-222	ENST00000610468	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MUC1-222	ENST00000610468	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	CHRNA5	P30532	468 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM70	O94826	608 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	STARD3NL	O95772	234 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	SERPINB2	P05120	415 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	TEF	Q10587	303 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MUC1-222	ENST00000610468	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087WZG4	1122 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	APLP1	P51693	650 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	PRKAR2B	P31323	418 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	TTLL6	Q8N841	843 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	CFAP53	Q96M91	514 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	SCN7A	Q01118	1682 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MUC1-222	ENST00000610468	PRELP	P51888	382 aa		18.64	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	RASSF7	Q02833	373 aa		18.64	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	IFFO2	Q5TF58	517 aa		18.64	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		18.64	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.64	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468		H0YIN7	160 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	CAMTA2	O94983	1202 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	LMNB1	P20700	586 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	FSTL1	Q12841	308 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		18.63	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	BTBD11	A6QL63	1104 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	NFKBIE	O00221	500 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	KCNQ3	O43525	872 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	A1BG	P04217	495 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	PPP2R1A	P30153	589 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	NUDC	Q9Y266	331 aa		18.62	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	PDE6B	P35913	854 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	RRAGC	Q9HB90	399 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	GLTPD2	A6NH11	291 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	SBF1	O95248	1867 aa		18.58	■□□□□ 0.57
MUC1-222	ENST00000610468	MCM10	Q7L590	875 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	CNBD1	Q8NA66	436 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	USP16	Q9Y5T5	823 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	RGL2	O15211	777 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	C21orf2	O43822	256 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	SRGN	P10124	158 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	STYK1	Q6J9G0	422 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF26	B4DH59	902 aa		18.53	■□□□□ 0.56

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